Werkzeuge: Ali Baba

Ali Baba – PubMed as a graph so der Titel eines nicht uninteressaten Werkzeugs das über die HU-Berlin-Seiten zugänglich ist. Mit dem Programm lassen sich Artikel über die PubMed durchsuchen und als graphisches Netzwerk darstellen. Die dargestellten Begriffe lassen sich nach Zellinie, Protein, Krankheit, Gewebe oder Medikament zuordnen und getrennt anzeigen. Zu den gefunden Begriffen gibt es außerdem Direktverlinkungen zur Pubmed, was bei entsprechender Anbindung die Überprüfung von dargestellten Zusammenhängen erleichtert. Problematisch im Vergleich zu anderen Mining-werkzeugen wie iHop ist, dass durch die graphische Darstellung Zusammenhänge letztlich so schematisiert dargestellt werden, dass das biologische Verständnis auf der Strecke bleibt. In Kombination kann man mit beiden Werkzeugen besser arbeiten, als mit einem allein, für den direkten Informationszusammenhang ist jedoch iHOP zur Zeit besser geeignet.